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用限制性內切酶切割目的樣本的基因組DNA,可以得到大量的DNA片段。將這些DNA片段與相應載體連接,轉化入受體細胞,并培養(yǎng)使其大量復復制。這樣,一個克隆內每個細胞的載體上都包含有特定的基因組DNA片段,整個克隆群體就包含基因組DNA的全部基因片段,即基因組文庫。
在基因組測序中,建庫測序是對提供的合格樣品進行建庫并運用illumina測序平臺測序,產生高質量的測序數據,從而為客戶進行生物信息學分析提供原始數據依據。
專業(yè)專注:10余年醫(yī)學科研行業(yè)經驗,課題項目皆由3年以上的專業(yè)科研人員負責
服務透明:項目反饋及時,階段性說明實驗項目進展情況,客戶無后顧之憂
硬件保障:實驗場地及相關設備對所有客戶開放,歡迎隨時參觀
結果保證:保證所有課題實驗數據的真實性、客觀性
優(yōu)質資源:學術資源豐富,涵蓋生物醫(yī)學大多數專業(yè),根據不同需求,提供個性化輔導協(xié)助
保密制度:嚴格執(zhí)行保密規(guī)程,充分保護客戶隱私信息,誠信簽訂保密協(xié)議
正規(guī)發(fā)票:提供支付寶、微信、銀聯等多種便捷支付方式,可出具正規(guī)增值稅發(fā)票
序列 | 服務內容 |
1 | 構建基因組測序所需要的基因組文庫 |
1、細胞、新鮮組織或總RNA/DNA樣品
2、細胞樣品或新鮮組織塊(切成~50mg的小塊)直接液氮凍存后,-80℃保存
3、樣品運輸:細胞或者組織樣品;或者總RNA樣本/DNA樣本置于1.5 ml管中,封口膜封好,干冰運輸
備注:不同測序方法,對樣本的要求不相同,請根據測序手段來確定送樣要求
14天
根據樣品類型和數量面議定價
全基因組DNA甲基化測序采用亞硫酸氫鹽處理基因組DNA使未甲基化修飾的Chemicalbook胞嘧啶C轉化為尿嘧啶U,通過對處理后的DNA進行全基因組重測序,并與參考基因組進行比對,從基因組水平實現單堿基分辨率的、高精確度甲基化水平分析。WGBS可以達到單堿基分辨率,精確分析每一個胞嘧啶的甲基化狀態(tài),從而構建精細的全基因組DNA甲基化圖譜。
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序列 | 服務內容 |
1 | 測序數據質量評估 |
2 | 與參考基因組比對 |
3 | 甲基化位點calling |
4 | 甲基化分布 |
5 | 差異甲基化分析 |
6 | 相關基因分析 |
7 | 多樣本分析 |
1、細胞,組織,總DNA等
2、建議起始量(單次):DNA>10ug,樣品濃度>50ng/ul, OD260/OD280在1.8到2.0之間
45天
根據樣品類型和數量面議定價
ChIP-seq:是一種將ChIP與第二代測序技術相結合的ChIP-Seq技術,能夠高效地在全基因組范圍內檢測與組蛋白、轉錄因子等互作的DNA區(qū)段。ChIP是研究體內蛋白質與DNA相互作用的有力工具。ChIP-Seq的原理是:首先通過染色質免疫共沉淀技術(ChIP)特異性地富集目的蛋白結合的DNA片段,并對其進行純化與文庫構建;然后對富集得到的DNA片段進行高通量測序。通過將獲得的數百萬條序列標簽精確定位到基因組上,從而獲得全基因組范圍內與組蛋白、轉錄因子等互作的DNA區(qū)段信息。
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序列 | 服務內容 |
1 | 測序數據質量評估 |
2 | 與參考基因組比對 |
3 | peak峰calling |
4 | motif分析 |
5 | peak峰相關基因注釋 |
6 | 差異peak分析 |
7 | 相關基因功能分析 |
1、細胞≥2×107個;動物組織量≥200mg;植物組織量:葉片≥1.5g,莖≥2 g。
2、IP產物及input:濃度>0.1ng/uL,體積≥15uL,片段長度200-500bp;通常input濃度≥50ng/uL,體積≥15uL(其它情況請聯系我們技術支持溝通)。
3、ChIP文庫濃度≥10nM,體積≥20μL,片段長度200-500bp。
45天
根據樣品類型和數量面議定價
lncRNA測序:通過lncRNA測序可以研究已有參考基因組物種的特定組織或細胞在某個特定時期轉錄出的所有lncRNA和mRNA,并進行相關生信分析。
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序列 | 服務內容 | |
lncRNA分析 | 原始數據和結果報告圖表 | |
1 | lncRNA拼接組裝 | |
2 | lncRNA位點篩選 | |
3 | lncRNA編碼潛能分析 | |
4 | lncRNA描述性統(tǒng)計 | |
5 | lncRNA靶基因預測 | |
6 | lncRNA保守性分析 | |
7 | ORF長度分析及exon個數分析 | |
8 | 表達水平分析及差異表達分析 |
1、細胞,組織,全血,總RNA等
2、建議總RNA起始量:10ug,最低5ug,人/大鼠/小鼠樣品可低至1ug,
3、濃度≥200 ng/uL(人/大鼠/小鼠樣品可低至≥50ng/ul)
45天
根據樣品類型和數量面議定價
轉錄組測序的研究對象為特定細胞在某一功能狀態(tài)下所能轉錄出來的所有RNA的總和,主要包括mRNA和非編碼RNA。通過新一代高通量測序,能夠全面快速地獲得某一物種特定組織或器官在某一狀態(tài)下的幾乎所有轉錄本序列信息,目前已廣泛應用于基礎研究、臨床診斷和藥物研發(fā)等領域。
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序列 | 服務內容 |
1 | 基因結構水平分析 |
2 | 與參考基因組比對 |
3 | 新轉錄本預測 |
4 | 可變剪切分析 |
5 | SNP分析 |
6 | InDel分析 |
1、細胞,組織,全血,血清,血漿,總RNA等
2、建議總RNA起始量:2ug,最低1ug,濃度≥50ng /uL
40天
根據樣品類型和數量面議定價
環(huán)狀RNA(circular RNA,circRNA)是一類特殊的非編碼RNA,它大量存在于真核細胞胞質內。近幾年的研究表明,circRNA在生物的生長發(fā)育、對外界環(huán)境的抵御等方面具有重要的調控作用。在功能上,circRNA分子富含microRNA(miRNA)結合位點,在細胞中起到miRNA海綿(miRNA sponge)的作用,從而解除miRNA對其靶基因的抑制作用,升高靶基因的表達水平;這一作用機制被稱為競爭性內源RNA(ceRNA)機制。通過與疾病關聯的miRNA相互作用,circRNA在疾病中發(fā)揮著重要的調控作用。
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序列 | 服務內容 |
1 | 參考序列比對 |
2 | circRNA鑒定 |
3 | circRNA來源基因分析 |
4 | circRNA表達水平定量 |
5 | 差異表達分析 |
6 | GO、KEGG富集分析 |
7 | miRNA結合位點預測 |
1、細胞,組織,全血,總RNA等
2、建議總RNA起始量:10 ug,最低5ug,濃度≥200 ng/uL
70天
根據樣品類型和數量面議定價
擴增子測序是對特定長度的PCR產物或者捕獲片段進行測序,對環(huán)境樣本進行16s、ITS、18s高變區(qū)擴增產物測序,通過檢測目的區(qū)域的序列變異和豐度,可研究環(huán)境中微生物的多樣性及群落組成差異。
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序列 | 服務內容 |
1 | 物種注釋 |
2 | α-多樣性分析 |
3 | β-多樣性分析 |
4 | 多元統(tǒng)計分析 |
5 | CCA分析 |
6 | 環(huán)境因子關聯分析 |
7 | VPA分析 |
8 | 功能預測 |
9 | 腸型分析 |
10 | 貝葉斯網絡圖 |
11 | Source Tracker |
【樣本要求】
1、菌體,DNA等
2、建議總DNA起始量:>20ng(較純DNA,無宿主及其他雜質污染)
10天
根據樣品類型和數量面議定價
宏基因組學(Metagenomics)通過直接從環(huán)境樣品中提取全部微生物的DNA并測序,利用組學的研究策略研究環(huán)境樣品所包含的全部微生物的群落組成及其群落(基因)功能。
宏基因測序是通過高通量測序技術對環(huán)境樣品中全部微小生物遺傳物質,包含了可培養(yǎng)的和未可培養(yǎng)的微生物的基因組進行測序分析,以微生物多樣性、種群結構、進化關系、功能活性、相互協(xié)作關系及與環(huán)境之間的關系為研究目的的新的微生物研究方法。
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序列 | 服務內容 |
1 | 測序數據質量評估 |
2 | 基因預測 |
3 | 物種、功能注釋 |
4 | CARD |
5 | CAG/MLG分析 |
6 | CNV(copy number variation) |
7 | 噬菌體 |
1、環(huán)境樣品,總DNA等
2、建議總DNA起始量:5 ug,最低0.5ug,濃度≥30 ng/uL(Qubit定量)
26.5天
根據樣品類型和數量面議定價